Historien til Madagaskar begynte for 160 millioner år siden, når øya separerte seg fra det Afrikanske fastlandet. På denne tiden eksisterte ikke pattedyr ennå (de dukket ikke opp før 100 millioner år senere), og det er derfor øyas fauna er helt annerledes enn den du vanligvis ser på fastlandet i Afrika.
Du kan ikke finne et eneste av pattedyrene i Madagaskar noe annet sted i verden. Det finnes kun et bemerkelsesverdig unntak, og det er flaggermusen, som greide å fly til denne Afrikanske øya fra fastlandet. Madagaskar er den fjerde største øya i verden og i tillegg en av de mest biologisk mangfoldige landene i verden. De enorme tropiske skogene på øya blir betraktet som et eldorado av forskere verden rundt. Selv ikke de store regnskogene i Sør-Amerika kan sammenligne seg med det umåtelige mangfoldet i Madagaskars flora og fauna.
Generelt er rundt 80 prosent av plante –og dyrelivet og 65 prosent av alle fugleartene du finner her endemiske for Madagaskar, som betyr at de bare bor på denne helt spesielle øya. Øyas natur har gitt overlevende dyr fra dinosaurtiden, som for eksempel kameleoner, et unikt habitat. Det bor hele 40 forskjellige arter på Madagaskar, som har den høyeste biodiversiteten av kameleoner i verden. Det bor også andre mystiske kreaturer i dette eksotiske riket som dvergkameleoner og tomatfrosker, og  øyas isolasjon fra fastlandet har ført til at unike trearter som apebrødtrær har vokst frem . Med andre ord er Madagaskar et tropisk paradis.
Høydepunkter
- Isalo nasjonalpark: er som et naturlig museum kun dedikert til de biologiske underverkene i denne ørkendalen. Juvene her er fylt med gule gressletter, vertikale steinvegger, og best av alt, dype daler hvor du vil finne turkise vannstrømmer, frodig natur og maleriske vannhull du kan svømme i. Alle disse naturlige fenomenene endrer seg med lyset og ser helt magiske ut ved solnedgang. Det er enkelt å komme seg hit fra en av øyas hovedveier, RN7, og man skjønner godt hvorfor dette er den mest populære nasjonalparken i Madagaskar. Heldigvis har Isalo nasjonalpark en størrelse på hele 800 kvadratkilometer og du vil definitivt ikke støte på plassproblemer når du  utforsker dette helt unike området
- Nosy Mangabe: Denne lille øya, som er plassert mellom de kystnære åsene i Antongila-bukten og som snirkler seg innenlands ved den nordøstlige kysten av Madagaskar, er et must-see for deg som er interessert i dyreliv. Du vil oppdage enorme fikentrær som gror side om side med palmetrær og lemurer og frosker som lusker i nærmeste kratt. Du kan også observere hvordan landskaper av grønn jungel plutselig går brått nedover og bortgjemte bukter og  gyllen sand kommer til syne. Båtturer til øya kan du bestille fra Maroansetra, som er den nærmeste havnelandsbyen på Madagaskar.
- Île Sainte Marie: er også en mindre øy utenfor østkysten til Madagaskar. Øya består av flere skånede bukter og viker som pleide å tiltrekke seg pirater i det 17. og 18. århundret. Du kan også se vrakene til flere piratskip fra det grunne vannet ved Baie des Forbans. I dag er dette en populær reisedestinasjon som også er et ideelt sted for å snorkle og se knølhvaler i løpet av sommeren og høsten.